dilluns, 17 de novembre de 2008

Bioinformatica i Playstation


Necessiteu una excusa per a comprar o que us regalin una Playstation3? Aquí en teniu una: Cada cop es fa servir més per fer Ciència. No, no és broma. Resulta que la gran potencia de càlcul del processador (anomenat Cell Broadband Engine, Cell BE) juntament amb el seu preu assequible, fan que sigui una opció interessant per a executar programes informàtics que requereixen una gran quantitat de càlculs. Així per exemple, alguns dels algoritmes bioinformàtics més usuals s'han implementat ja per poder-los executar en una Playstation 3. Algunes de les implementacions ja existents o en desenvolupament són:
De fet, una de les primeres notícies que vaig tenir sobre aquesta utilització provenia d'un grup de recerca de l'IMIM-UPF. Aquest grup ha iniciat el que s'anomena PS3GRID, una xarxa d'usuaris de videoconsoles que vulguin col·laborar en investigacions científiques. Consisteix en instal·lar un petit programa en una Playstation3, i cedir la potència de càlcul de la màquina durant les estones que està en marxa però en les que l'usuari no l'està fent servir, i col·laborar així en la recerca científica, en aquest cas sobre simulacions moleculars que estudien el plegament de les proteïnes. No és la única iniciativa de xarxa d'usuaris que cedeixen les seves CPUs. Al projecte Folding@Home també dedicat a la comprensió del plegament i agregació de les proteïnes i les malalties relacionades, es pot contribuir des de qualsevol ordinador i sistema operatiu. Però és a través de la Playstation3 que reben més resultats, tot i tenir menys usuaris. I qui no recorda el projecte SETI, l'impulsor d'aquest tipus de xarxes, en aquest cas per la recerca de vida extraterrestre.

6 comentaris:

Asimetrich ha dit...

A mi això em sona excusa per comprar-te una play pel teu despatx jejeje.

Pere ha dit...

Estava pensant el mateix asimetrich jejeje! Per cert el projecte PS3Grid que parles està en part relacionat també amb el seti, ja que ambdós formen part del projecte boinc (http://boinc.berkeley.edu), que té molts tipus de projectes on la gent pot baixar-se un programa al ordinador i cedir part de la seva potencia de calcul. Em sembla una bona idea.

Vallve ha dit...

Doncs no estaria malament. En el proper projecte que demani podem posar una sèrie de Playstation per fer un clúster ....

Pere ha dit...

per jugar en xarxa clar :P

Albertinho ha dit...

Només faltaria això al departamnet...trafic de playstations!!!
Que voleu que us digui, això de cedir potència de càlcul així per la face, mentre el govern que és qui hauria d'invertir en recerca inverteix en tancs per matar, doncs com que no ho veig massa clar....

Anònim ha dit...

Ei, que he vist que has tornat a ser destacat com a Entrada interess(ADN)ts en el blog Així de Simple, així de natural. Enhorabona